More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0119 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  33.73 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.31 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  21.34 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  28.86 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  26.32 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  24.39 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  28.57 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  28.57 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  28.57 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 244 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 240 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  24.22 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 770 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>