More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2194 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  88.6 
 
 		 193 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  88.6 
 
 		 193 aa  343  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  87.56 
 
 		 193 aa  338  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 200 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  30.08 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  45.1 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.45 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  29.73 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 260 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  39.66 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 255 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32.53 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 259 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  36.96 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 227 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3449  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>