More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4491 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  24.62 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.48 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  23 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  25.96 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 174 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  34.83 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 257 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.34 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  22 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>