More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3637 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  98.55 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  98.55 
 
 		 207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  76.81 
 
 		 206 aa  310  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  78.22 
 
 		 206 aa  308  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 225 aa  191  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  50.52 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  50.54 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  47.8 
 
 		 197 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  49.38 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 160 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  53.09 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  49.43 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.43 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  49.69 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  45.86 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  51.75 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  48.24 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 363 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 425 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 400 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 410 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  32.24 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 408 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  28 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 412 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 424 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 406 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 451 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  26.17 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 451 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 428 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 394 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 394 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 394 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  32.89 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>