246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3200 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  481  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  37.05 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 278 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  31.88 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 276 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  29.72 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  28.21 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  29.33 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  27.36 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 260 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  25.53 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  28.51 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  23.04 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  37.36 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 199 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  28.32 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  25.12 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 174 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  30.61 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  27.59 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  24.54 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 150 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.63 
 
 		 228 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>