236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2982 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  58.7 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  63.44 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 283 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 254 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 278 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  32.02 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  38.65 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  33.75 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 241 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 260 aa  98.6  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  28.45 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 217 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  29.39 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  32.31 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  29.61 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  23.58 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  27.47 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  24.17 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 191 aa  52.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 247 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 208 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  23.78 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  24.03 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25.18 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>