67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1731 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  47.73 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  37.73 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  31.56 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  30.24 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 247 aa  85.9  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  27.52 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  26.55 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  20.18 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  20.63 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  21.08 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  31.16 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.39 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.86 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  22.94 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 235 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>