203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2316 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  64.66 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 278 aa  265  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  51.75 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  48.03 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0872  regulatory protein, TetR  51.56 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  51.3 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  47.83 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  46.64 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3810  TetR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3004  regulatory protein TetR  39.19 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587932  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  39.38 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  35.43 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2888  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3766  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0550  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 283 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5775  hypothetical protein  32.41 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11960  transcriptional regulator, tetR family  37.04 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1731  hypothetical protein  34.34 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.806677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8207  putative transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  29.17 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5555  putative transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10720  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.676593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2845  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168964  decreased coverage  0.00129293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1913  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0095  TetR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  26.58 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.71 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 477 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 477 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  30.16 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  26.87 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  41.43 
 
 		 510 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  26.32 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>