More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6363 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  65.37 
 
 		 229 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  57.07 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  43.2 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  42.36 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 206 aa  98.2  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  40.48 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  36.52 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.36 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  38.42 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.64 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  28.31 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  21.97 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>