More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4250 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  48.52 
 
 		 222 aa  128  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  46.99 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 208 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  53.77 
 
 		 222 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 212 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 193 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 240 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  52.83 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 202 aa  84.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  42.73 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  40.54 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  49.07 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 235 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  35.88 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  38.76 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  39.81 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.16 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.81 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  32.57 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
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NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  34.73 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
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NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
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NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
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NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  39.25 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
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NC_009664  Krad_2707  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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