More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4758 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  83.19 
 
 
234 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  82.76 
 
 
234 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  88.26 
 
 
236 aa  360  9e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  80.59 
 
 
237 aa  360  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  81.03 
 
 
235 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  82.7 
 
 
239 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  64.59 
 
 
211 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
205 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
205 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
203 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  55.45 
 
 
205 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  53.23 
 
 
205 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  51.24 
 
 
205 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  48.5 
 
 
205 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 
214 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  44.34 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  44.34 
 
 
228 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  43.87 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
225 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 
207 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  38.12 
 
 
206 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 
212 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
186 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  37.56 
 
 
190 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 
206 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
204 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
203 aa  92  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
211 aa  89  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 
206 aa  88.2  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  35.5 
 
 
200 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
208 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
181 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 
206 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
184 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
204 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.73 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 
195 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 
199 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  36.7 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  28.25 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  38.39 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  35.67 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 
209 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.59 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1066  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.52451  normal  0.686522 
 
 
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NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
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NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
202 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  36.36 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
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NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
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NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.731504 
 
 
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