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for query gene Sde_1314 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.79 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  25.54 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  26.4 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  29.41 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 333 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  25.67 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  28.14 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  26.73 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
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NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
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NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
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NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  24.72 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1551  hypothetical protein  28.02 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.494685  n/a   
 
 
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