256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3565 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 191 aa  376  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 222 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  43.69 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  40.09 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 220 aa  124  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  42.03 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 234 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 225 aa  121  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 219 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 233 aa  111  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  40.8 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  39.16 
 
 		 190 aa  97.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 203 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 206 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  41.18 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  31.4 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.11 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  38.74 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  32.21 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.3 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  33.12 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>