More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4343 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 203 aa  94.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 243 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
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NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.33 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.53 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
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NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.95 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
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NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  31.33 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.12 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 257 aa  68.2  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  33.73 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  38.18 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.39 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
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NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
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NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
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NC_013947  Snas_0120  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.654836  normal  0.0157031 
 
 
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NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
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NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 333 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 307 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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