More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2830 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  95.65 
 
 		 228 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  95.17 
 
 		 208 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  81.69 
 
 		 225 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  80.39 
 
 		 216 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  80.1 
 
 		 214 aa  299  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  44.76 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 237 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  41.09 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  39.61 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  36.41 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  45.3 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  37.84 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  30.95 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  41.91 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  31.58 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  34.62 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  28.35 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
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NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
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NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  45.12 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
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NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
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NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
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NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
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NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  19.64 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 333 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
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NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  32.46 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
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