172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4026 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4026  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.62673  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2263  TetR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.89343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  60.1 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4103  TetR family transcriptional regulator  63.94 
 
 		 216 aa  225  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  65.09 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  65.09 
 
 		 214 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4769  TetR family transcriptional regulator  60.99 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03880  putative transcription regulator protein  64.62 
 
 		 214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  61.65 
 
 		 218 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  47.57 
 
 		 191 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  46.83 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 230 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  44.6 
 
 		 211 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  43.4 
 
 		 240 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  44.61 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 222 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 191 aa  88.2  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  36.61 
 
 		 190 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  36.1 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2111  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  33.51 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.18 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  59.32 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  32.78 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  27.22 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6348  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 400 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00107036  hitchhiker  0.00103053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  29.65 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  28.65 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
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NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1066  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.52451  normal  0.686522 
 
 
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NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
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