231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2424 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  28.35 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  26.92 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 226 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4409  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.182996  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  25.27 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3499  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553383  normal  0.3226 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4571  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.281671  normal  0.592331 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  25.96 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4058  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  25.51 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 243 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  28 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 261 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  32.35 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  19.29 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  25.45 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0524  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.576052  hitchhiker  0.0000164085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0167  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.266146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  22.06 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0172  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 202 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>