More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0970 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 198 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 253 aa  98.2  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
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NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  36.79 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
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NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  40 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  42.37 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 330 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
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NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
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NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  34.4 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  29.33 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  36.76 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1131  transcriptional regulator RutR  36.76 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.33999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  36.76 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  36.76 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  36.76 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 187 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  43.64 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  43.64 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 231 aa  51.2  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
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NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
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NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  39.44 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
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NC_007643  Rru_A2863  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  41.79 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
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