More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4581 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  45.29 
 
 		 253 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2449  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 196 aa  114  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  34.48 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  42.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 233 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.86 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  34.19 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.36 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 287 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2244  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2348  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  39.06 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 470 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 482 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 482 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 434 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 233 aa  47.8  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>