More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2456 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 253 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  22.33 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.68 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  32.35 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 260 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1946  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  hitchhiker  0.00972871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1759  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.31 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 244 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.31 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  44.68 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>