More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0536 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  61.88 
 
 		 204 aa  245  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 200 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 497 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4369  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  26.06 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 275 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7595  transcriptional regulator TetR family  31.41 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  39.13 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  27.88 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  25.62 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  21.01 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 349 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  42 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>