More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1692 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 200 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  30.59 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  45.28 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  45.28 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  37.29 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>