213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04360 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  98.6  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0460  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466873  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  30.43 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1882  regulatory protein TetR  25.35 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 236 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.21 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>