More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1444 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04360  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  41.51 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 287 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  37.29 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 289 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  40.58 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  28.57 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5181  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  36.07 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  38.24 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10234  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2778  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0630256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  41.07 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>