More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1550 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7911  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0417125  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  50 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2778  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0630256 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 271 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2192  regulatory protein TetR  38.71 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  24.12 
 
 		 264 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 246 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3834  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1710  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1633  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  45.83 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.46 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>