More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0465 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0465  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  69.85 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  57.45 
 
 		 201 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  28.46 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.14 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  39.68 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  33.67 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  36.59 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 309 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>