127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2192 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2192  regulatory protein TetR  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  21.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 310 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  24.38 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  21.2 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 290 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  20.41 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  25 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 305 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  28.99 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 289 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 291 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  34.55 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  23.76 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 297 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 207 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 186 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  22.37 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  20.13 
 
 		 202 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>