231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2076 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  40.64 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  35.36 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  46.02 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  43.97 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 203 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  50.88 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  35.64 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  43.33 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  47.37 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  30.57 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 308 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  34.78 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 317 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  40.98 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  40.98 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  40.98 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  36.25 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  36.71 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  35.38 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  35.82 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>