More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2774 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  36.57 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  36.04 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  30.11 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  34.51 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  32.95 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.41 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  40.74 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  25.86 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  40.35 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  40.35 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>