More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5896 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 196 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 198 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  38.19 
 
 		 203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  36.27 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 192 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 367 aa  95.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 206 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  32 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.92 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  29.78 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  30.11 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  29.21 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  27.86 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  25.64 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  33.77 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  31.96 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  27.72 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  24.1 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  25.38 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  24.1 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  27.13 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  28.25 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  25.79 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  28.25 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  28.25 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  25.96 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  29.01 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  28.29 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  30.07 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  26.26 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  26.26 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  26.26 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  26.26 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  26.26 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  26.26 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  27.22 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.52 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  27.22 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  26.26 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  27.22 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>