127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8695 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  44.5 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 367 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  33.17 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 197 aa  84.7  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  37.11 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  31.58 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  32.82 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  38.4 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  36.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  40.62 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  32.72 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  23.76 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  46.94 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 245 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0393  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 420 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>