198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7124 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  41.67 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 197 aa  97.8  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 199 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  37 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  38.12 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 177 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  43.56 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  41.12 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  31.22 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  33.08 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  39.34 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  39.47 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  31.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 308 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  34.48 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.93 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  46.43 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  32.93 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  47.17 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  31.08 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  47.17 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  33.89 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>