More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2956 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31770  hypothetical protein  32.49 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.590627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  29.57 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  35.04 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  54 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  43.08 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  42.03 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  39.77 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  40.51 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  29.67 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  34.86 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  34.86 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  34.86 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  37.5 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.27 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  42.03 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  41.18 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  35.04 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  42.86 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  36.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  36.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  36.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  36.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  36.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  36.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  36.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>