More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1923 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  99.49 
 
 		 202 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  94.85 
 
 		 195 aa  349  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  89.58 
 
 		 194 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  89.58 
 
 		 194 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  89.58 
 
 		 194 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  88.54 
 
 		 194 aa  347  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  88.54 
 
 		 194 aa  346  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  88.54 
 
 		 194 aa  346  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  89.58 
 
 		 194 aa  334  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  84.38 
 
 		 196 aa  333  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  80.93 
 
 		 195 aa  293  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  81.96 
 
 		 195 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  60.32 
 
 		 196 aa  243  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  56.77 
 
 		 198 aa  233  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  59.04 
 
 		 198 aa  230  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  54.92 
 
 		 197 aa  227  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  54.92 
 
 		 197 aa  227  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  54.08 
 
 		 197 aa  226  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  60 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  60 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  53.37 
 
 		 218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  53.33 
 
 		 218 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  57.75 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  52.82 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  54.69 
 
 		 195 aa  221  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  57.22 
 
 		 195 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  57.22 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  57.22 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  57.22 
 
 		 195 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  57.22 
 
 		 195 aa  218  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  57.22 
 
 		 195 aa  218  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  57.22 
 
 		 195 aa  217  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  57.22 
 
 		 195 aa  217  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2915  transcriptional regulator BetI  55.23 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  54.79 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  47.15 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  47.67 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  47.92 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  47.92 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  47.92 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1948  transcriptional regulator BetI  45.6 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  47.4 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  49.13 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  47.06 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1009  transcriptional regulator BetI  47.98 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1121  transcriptional regulator BetI  49.13 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  46.28 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  45.99 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 195 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  46.28 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  45.83 
 
 		 196 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  46.39 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  40.84 
 
 		 198 aa  148  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  40.84 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  43.64 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 196 aa  141  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  39.79 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  39.79 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  40.96 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  38.5 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  36.7 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  40.31 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  42.24 
 
 		 677 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1151  transcriptional regulator TetR family  34.71 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1671  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.290262  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 216 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  30.46 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  34.71 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>