124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3202 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 240 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  35.16 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  28.19 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  36.49 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 263 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1041  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1692  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.474881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  39.22 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  21.57 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  29.82 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1767  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 218 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  32.38 
 
 		 207 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>