296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2894 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 193 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2752  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  34.41 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  54.72 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3202  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3575  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12460  hypothetical protein  48.98 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0070  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  43.1 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 235 aa  48.9  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 189 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 223 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  35.35 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  37.8 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2069  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.620568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0326  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  31.94 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.38 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  28.38 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  44.26 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0905  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  0.145255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>