More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5790 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 192 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 367 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  32.77 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  39.17 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  27.87 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  29.51 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  30.4 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  28.69 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  31.15 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  30.4 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  31.15 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  31.25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  31.25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  31.25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  38.89 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  28.69 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  28.69 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  34.19 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  28.69 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  28.69 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  30.47 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  29.51 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  31.82 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  30.33 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 677 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  27.87 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  27.64 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  33.62 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  27.34 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0713  transcriptional regulator BetI  24.56 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0124161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 277 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>