More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2212 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  378  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  89.9 
 
 		 206 aa  295  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  68.72 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  40.88 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  36.11 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.68 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  33.52 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  30.46 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  34.4 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  46.55 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  30.08 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4012  transcriptional regulator BetI  42.86 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.4529  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  25.69 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  40.79 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  25.29 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  31.11 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  42.11 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2762  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.857853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  29.82 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  31.16 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>