More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2855 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  34.18 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 367 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  27.84 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  26.63 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  45.9 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  35.29 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  22.34 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 287 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  25.26 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  32.18 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.37 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  40 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 245 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 291 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 289 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  18.95 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  24.59 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 307 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  23.97 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2192  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  23.97 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  21.28 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>