More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2094 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  30.69 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  36.62 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  27.12 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>