150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2399 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  79.9 
 
 		 205 aa  309  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 199 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 197 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 367 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  42.29 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  35.57 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  41.24 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4314  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.668708  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  33.74 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  34.19 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  31.15 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  28.81 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  30.72 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  30.23 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  24.38 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  30.46 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  28.81 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  28.81 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30040  hypothetical protein  32.81 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000857921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  31.15 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  31.15 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  41.38 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  29.25 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  25.6 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1071  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0689162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>