More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2074 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  72.04 
 
 		 187 aa  267  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  71.51 
 
 		 187 aa  264  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  71.12 
 
 		 187 aa  263  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 192 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  69.15 
 
 		 199 aa  258  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  75.14 
 
 		 198 aa  254  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  64.77 
 
 		 198 aa  248  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 190 aa  220  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 190 aa  214  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  55.79 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  58.6 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  44.62 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 307 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  43.55 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  47.92 
 
 		 260 aa  53.9  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  42.11 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  41.43 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  35.71 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 236 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35.9 
 
 		 230 aa  52  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 236 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>