More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2448 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  98.44 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  90.37 
 
 		 187 aa  340  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  89.78 
 
 		 187 aa  333  7.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  82.26 
 
 		 187 aa  310  7.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  70.59 
 
 		 189 aa  263  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  63.49 
 
 		 199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  66.32 
 
 		 198 aa  227  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  60.82 
 
 		 198 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 190 aa  213  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 190 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  54.84 
 
 		 186 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  44.62 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  42.37 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  38.46 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  25.84 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.33 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 310 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 287 aa  52  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 260 aa  51.6  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 175 aa  51.6  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 236 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  51.2  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>