191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0237 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  353  8.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 231 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  23.78 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 200 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  20.14 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 226 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  22.33 
 
 		 225 aa  47.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  27.44 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  25.24 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 246 aa  46.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  22.86 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 204 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  19.41 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 227 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  24.41 
 
 		 231 aa  44.7  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 272 aa  44.7  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 229 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  21.62 
 
 		 225 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 343 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 208 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 206 aa  44.3  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 194 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 200 aa  44.3  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 225 aa  44.3  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 206 aa  44.3  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  28.57 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  32.2 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 238 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  25.22 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  21.86 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  20.13 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>