More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1978 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  381  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 195 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  59.36 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  65.7 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  65.19 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  55.44 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  52.49 
 
 		 222 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  55.19 
 
 		 195 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  61.2 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  54.95 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  55.35 
 
 		 204 aa  160  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 225 aa  157  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 193 aa  151  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 160 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  46.86 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  45.41 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  48.59 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 220 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 400 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  40.85 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 425 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 363 aa  84.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 408 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.03 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  32.68 
 
 		 403 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 410 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 388 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 424 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 394 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 394 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 394 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  61.36 
 
 		 470 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 412 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5749  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 446 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 438 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>