More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0013 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 424 aa  841    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 410 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 428 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  38.9 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  29.26 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 394 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 193 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 309 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 220 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 197 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 206 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 197 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 193 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 204 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 193 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  31.62 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 216 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 201 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 205 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 230 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 222 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 207 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 260 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 212 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 195 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 223 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 221 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 266 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.28 
 
 		 200 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 201 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 223 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 224 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 209 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 190 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 206 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  38.57 
 
 		 237 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 245 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 273 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 198 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 248 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  22.34 
 
 		 190 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>