More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3263 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  67.66 
 
 		 190 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  58.79 
 
 		 195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  61.75 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  57.54 
 
 		 197 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  52.25 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  55.23 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  61.18 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  48.92 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  48.74 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 220 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  49.72 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  49.38 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  46.7 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 193 aa  131  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 408 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 425 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 410 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 363 aa  99  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  41.96 
 
 		 215 aa  99  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 403 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 424 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 451 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 451 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 309 aa  92  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 428 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 400 aa  89.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 391 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 406 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 388 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  31.41 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 394 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 394 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 394 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 393 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 470 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  42.22 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>