More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2329 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  67.74 
 
 		 186 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 187 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 223 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 241 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  26.9 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  25.48 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  24.07 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.07 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.07 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  23.71 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.19 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.19 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  24.19 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  21.43 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.14 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  24.75 
 
 		 226 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  21.66 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>