More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5380 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 203 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 232 aa  85.9  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  37.23 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  25.15 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  26.63 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  35.44 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  29.55 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  25.95 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  22.16 
 
 		 346 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 297 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  24.55 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.46 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.22 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  35.9 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  28.69 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 287 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  34.12 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 98 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  23.9 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>