More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0140 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  359  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  57.22 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  60.99 
 
 		 196 aa  191  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  57.87 
 
 		 197 aa  188  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 222 aa  167  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 225 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  49.72 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  54.04 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 206 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  55.35 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  52.41 
 
 		 206 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  43.72 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  49.72 
 
 		 199 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  49.72 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  46.81 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 220 aa  104  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 363 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 400 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 425 aa  84.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 393 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 470 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 403 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  34.11 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  27.87 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  44.09 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 238 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 391 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 202 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>